آنتي بيوتيك ها در دندانپزشكي به دو منظور تجويز مي شود:
1-درمان و كنترل عفونت
2- پيشگيري پروفيلاكسي
در موارد خاص(مثلاً اندوكارديت باكتريال و مانند آن) استفاده مي شود. دستور العمل قطعي مبني بر عدم تجويز آنتي بيوتيك در دندان به علت التهاب پالپ يا عصب دندان وجود دارد. بنابراين تجويز آنتي بيوتيك براي تمام موارد درد دندان صحيح نيست اما استفاده از مسكن براي تسكين درد توصيه مي‌شود تجويز آنتي بيوتيك فقط به وسيله دندانپزک ها انجام مي‌شود.